Berikut adalah penyakit atau komplikasi yang paling penting yang disebabkan oleh penyakit tangan-kaki-dan-mulut (HFMD):
Kulit dan subkutan (L00-L99).
- Onycholysis (pelepasan separa plat kuku dari katil kuku) atau onychomadesis (detasmen lengkap plat kuku dari tempat tidur kuku) - dalam kursus atipikal: Kehilangan kuku dan kuku kaki (biasanya dalam masa empat minggu selepas jangkitan).
Jiwa - sistem saraf (F00-F99; G00-G99).
- Encephalitis (keradangan otak), aseptik (sangat jarang berlaku).
- Meningitis (meningitis), aseptik (sangat jarang berlaku).
- Paresis (lumpuh), seperti polio.