Kesan yang tidak diingini
Kesan buruk dari kortison secara langsung berkaitan dengan kesan yang diinginkan. Kerana kortison mengganggu metabolisme gula, protein dan tulang serta air badan seimbang, pengambilan kortison dosis tinggi dalam jangka masa yang lebih lama boleh, misalnya, menyebabkan peningkatan secara kekal darah tahap gula atau kehilangan tulang (osteoporosis). Begitu juga dengan tanda-tanda Penyakit Cushing boleh menjadi kesan yang tidak diingini kortison, seperti wajah bulan purnama, batang lemak atau kelemahan otot.
Untuk mengelakkan kesan sampingan ini, dos kortison telah ditentukan (yang disebut Ambang Cushing, sehingga berlakunya Sindrom Cushing sangat tidak mungkin. Di samping itu, kortison melemahkan sistem imun, yang menghalang reaksi pertahanan terhadap kuman dan menjadikan jangkitan lebih mudah. Pemberian kortison melalui ubat juga mengganggu rangkaian kawalan hormon pembentukan kortison badan sendiri.
Atas sebab ini, terapi dengan kortison tidak boleh dihentikan secara tiba-tiba. Sebaliknya, badan harus diberi masa untuk menyesuaikan diri dengan perlahan-lahan mengurangkan dos agar dapat menghasilkan kortison yang mencukupi lagi. Pengambilan alkohol secara serentak, terutamanya dalam jumlah yang lebih besar, dapat meningkatkan kadar alkohol kesan kortison dan dengan itu juga membawa kepada lebih banyak kesan sampingan (lihat: Kortison dan alkohol - adakah ia boleh diterima?).
